При падении в шахту реактора Звезды Смерти Сидиус не погиб.Точнее,тело его погибло, но дух остался в Силе.Он переселился в один из клонов,приготовленных ранее. После этого Император затаился на шесть лет,ничем не выдавая своего существования. Он наблюдал за Галактикой.Наблюдал за возрождающейся Республикой. И строил новое оружие-Опустошители Миров.

Наконец,он решил вновь взять бразды правления в свои руки.Для этого ему нужен был Люк Скайуокер.Дав ему почувствовать свое присутствие,он захватил его в некое подобие гиперпространственной воронки и переместил на корабль-тюрьму, который во времена Войны Клонов использовался для перевозки пленных джедаев. Корабль доставил Люка на планету Бисс,где и ожидал его Сидиус. Он рассказал ошеломленному джедаю о способе,с помощью которого он каждый раз возрождается в новом клоне.Но качество клонов все ухудшается и ухудшается.... Сидиус предложил Скайуокеру стать своим учеником,предложив возможность победить его,Сидиуса,изучив Темную сторону.Люк согласился. Сидиус предоставил своему новому ученику командование флотом Опустошителей. Противостоять ему не могло ничто-даже флот Каламари.

Во время сражения имперцы захватили Тысячелетний Сокол-с Хэном,Леей Соло и Чубаккой на борту.Дарт Сидиус попытался склонить на Темную сторону Органу-Соло,приказав ей убить Люка.Но та отказалась,попытавшись направить свое оружие против Сидиуса. Тот разрушил ее оружие,и в наказание,немного поджарил ее молнией Силы. Через некоторое время Император приказал привести Лейю к себе.Он показал ей голокрон джедаев.После этого Император почувствовал,что его тело вновь умирает... Он сказал Лейе,что вселится в ребенка,которого она носит,для того,чтобы испытать ее. Лейей овладел гнев-как и предвидел Сидиус.Она перевернула ложе Императора и скрылась, взяв голокрон.Сидиус сломал ногу.

После этого,Сидиуса привезли в лабораторию клонирования,для переноса духа в один из клонов. Но туда пришел Скайуокер,с целью уничтожить всех клонов.Император уничтожил свое тело, чтобы успеть переселиться в уцелевший клон.Скайуокер не успел уничтожить всех, и Сидиус возродился.В дуэли на световых мечах он победил Скайуокера,и тот вновь стал покорен своему мастеру.

Императору был нужен голокрон,взятый Лейей.В послании Альянсу он приказал выдать ему Лейю.Та вернулась на корабль Сидиуса добровольно.Император хотел вселиться в тело еще нерожденного сына Органы,но не смог.Тогда он приказал Скайуокеру склонить Лейю на Темную сторону.Но Органа вернула своего брата на Светлую сторону. В дуэли Скайуокер отрубил Императору руку. Дарт Сидиус в гневе создал шторм Силы,чтобы уничтожить флот Альянса,но Люк и Лейя,обьединившись в Силе,направили мощь,созданную Сидиусом против него самого. Это был конец Императора.